Denke mal das ist eine Sache die der Spielleiter regeln muss. Also ich würded das so handhaben.
1) Man bekommt nur für erfolgreiche Missionen Prämien, wenn die Mission scheitert muss jamand die Dreck wegräumen, die Aktion vertuschen,...
2) Besondere Erfolge sollte auch belohnt werden, entweder hat man wie z.B. bei Permafrost einen Reaktor erbeutet, das bringt natürlich Geld und vielleicht auch ansehen. Natürlich bringen auch erbeutet Gegenstände Möglichkeit zum Forschen.
3) OMEGA ist eine Militärorganisation, ich sehe die Spezialisten als einfache Soldaten und den Gruppenfüher als Offizier. Natürlich gibt es Ränge beim Militär, man fängt z.B. als Soldat an, wird zum Gefreiten, dann zum Obergefreiten und so weiter. Ich würde pro Beförderung natürlich ein Gehaltbonus geben, vielleicht von 10% pro höheren Rang. Natürlich hat man auch als höher gestellter Soldat bzw. Offizier etwas mehr einfluss.
Hoffendlich hilft das weiter.